Esta organización sindical, también bajo la bandera de la ANEP, se encarga de atender los asuntos sociolaborales y reivindicativo gremiales de los socios y de las socias de la ANEP que laboran para el Sistema Penitenciario Nacional (incluyendo la sede central de la institución), en los sectores profesional, técnico, administrativo y operativo.
Su accionar también comprende la defensa de todos los intereses de todos los compañeros y de todas las compañeras del SPN de los indicados sectores; además de coordinar sus acciones con la organización hermana gemela en la institución, la Seccional ANEP-Policía Penitenciaria (ANEP-PP).
La agenda de lucha de la Seccional ANEP-SPN comprende temas como la situación de crisis del Sistema Penitenciario Nacional, su fortalecimiento (especialmente en materia de Recursos Humanos y de Salud Ocupacional), la defensa del empleo público que ejercemos y por tener, con la unión de trabajo y de lucha entre las dos seccionales, nuestra Primera Convención Colectiva de Trabajo. Además de las luchas nacionales que la ANEP promueve en defensa de los derechos de toda la clase trabajadora costarricense.